Sejarah Dinas Pendidikan dan Kebudayaan Kabupaten Kolaka Utara berawal dari adanya otonomi daerah yang telah ditetapkan undang-undang nomor: 22 Tahun 1999 tentang Pemerintah Daerah di Bidang Pendidikan dan Kebudayaan merupakan kewenangan yang wajib dilaksanakan oleh Kabupaten/Kota, untuk melaksanakan kewenangan tersebut maka DINAS PENDIDIKAN dan kebudayaan dibentuk Peraturan Daerah (PERDA) dengan persetujuan Dewan Perwakilan Rakyat:

Dan pada akhirnya dibentuklah Dinas Pendidikan Nasional Pemuda dan Olahraga melalui Peraturan Daerah Kabupaten Kolaka Utara Nomor    24   Tahun 2008  tentang organisasi dan tata kerja  kecamatan dan kelurahan (lembaran Dinas Pendidikan Pemuda dan Olahraga), dengan Susunan organsisasi tediri dari

  1. Kepala Dinas;
  2. Sekretariat, terdiri dari :
  3. Sub Bagian Kepegawaian;
  4. Sub Bagian Umum dan Perlengkapan;
  5. Sub Bagian Perencanaan dan Keuangan.
  6. Bidang Peningkatan Mutu Pendidik dan Tenaga Kependidikan (PMPTK) terdiri dari :
  7. Seksi Profesi Pendidikan;
  8. Seksi Pendidik dan Tenaga Kependidikan Formal dan Non Formal;
  9. Seksi Pembinaan Pendidikan dan Pelatihan.
  10. Bidang Pendidikan Dasar, Menengah dan Perguruan Tinggi terdiri dari:
  11. Seksi Kurikulum; 2. Seksi Kesiswaan; 3. Seksi Sarana Prasarana dan Ketenagaan.
  12. Bidang Pendidikan Luar Sekolah terdiri dari :
  13. Seksi Pendidikan Anak Usia Dini;
  14. Seksi Pendidkan Kesetaraan;
  15. Seksi Pendidikan Masyarakat, Pembinaan Kursus dan Kelembagaan.
  16. Bidang Pemuda dan Olah Raga terdiri dari :
  17. Seksi Pemuda;
  18. Seksi Olahraga Pembinaan Bakat dan Prestasi Siswa;
  19. Seksi Olahraga Masyarakat dan Penyandang Cacat.
  20. Unit Pelaksana Teknis Dinas (UPTD) :
  21. Kelompok Jabatan Fungsional.

Di tahun 2017, bidang Pemuda dan olahraga kemudian berdiri sendiri sehingga Diknaspora berubah nama menjadi Dinas Pendidikan dan Kebudayaan (Disdikbud) Kabupaten Kolaka Utara, dengan 3 (tiga) Bidang yaitu Bidang Dikmas dan Kebudayaan, Pembinaan PAUD dan Pembinaan Dikdas.

Pada tahun 2019, Dinas Dikbud Kolut kemudian terbagi menjadi 4 (empat) bidang yaitu, Bidang Paud dan PNF, Bidang Dikdas, Bidang GTK dan Bidang Kebudayaan